開催趣旨
本ハッカソンは、文部科学省 学術変革領域研究(A)「行動変容生物学」の取り組みとして、研究者を目指す若手(大学院生・学部生・ポスドク等)を対象に開催します。
3日間のイベントでは、マウスの行動実験データと対応する神経活動データを包括した「BraiDyn-BCデータベース」を用います。ハッカソンでは、神経科学データの取り扱い、行動解析、機械学習技術の応用など、多岐にわたるテーマに挑戦することができます。専門家によるチュートリアルを通じて、参加者は最新の研究手法や技術についての理解を深めながら、実践的なデータ解析スキルを磨いていただきます。チーム単位での協働作業を通じて、参加者は学際的な視点を養い、複雑な生物学的問題に対するアプローチを学べるでしょう。
チーム(5名程度)ごとに専門のチューターがつきますので、神経科学の初学者も歓迎します。最終日にはチームで作業した内容の発表と質疑応答を行い、主に学術的な視点からフィードバックを行います。
作業内容
学術変革領域A・行動変容生物学の総括班で作成したマウスの大規模な神経活動と行動のデータベース「BraiDyn-BC(Brain Dynamics and Behavior Change)データベース」を利用したデータ解析を行っていただきます。事前準備から本番3日間の大まかな流れは以下の通りです。
事前準備
事前学習ハッカソンに向けた基礎知識の共有と、研究の「問い」の立て方を学びます。データベース構造やColabチュートリアルコードを解説。(※参加できない方向けに後日YouTube公開)
1日目
チーム分け&開発会場にてチームを結成し、早速テーマ設定とデータ解析をスタート。夜には懇親会で交流を深めます。
2日目
WBAI企画&集中開発全脳アーキテクチャ・イニシアティブ企画(セミナー)を挟みつつ、チームで集中して解析・開発を進めます。
3日目
スライド作成&発表成果をまとめるスライド作成に集中し、最後は各チームによる発表会とフィードバックを実施します。
全体として今回のハッカソンは経験者だけでなく初学者を歓迎しますので、神経科学に興味のある方は奮ってご参加ください。
前回の開催風景(第1回ハッカソン)
2025年2月に開催された第1回ハッカソンの様子です。全国から集まった若手研究者・大学院生・学部生がチームを組み、講義やディスカッションを通じて熱心に開発に取り組みました。
講義・全体セッション
全体講義・導入セッション
チーム開発・議論
グループワーク・解析開発
第1回 集合写真
第1回ハッカソン 参加者集合写真
利用するデータベースとツール
タイムテーブル
事前準備
Online Preparation
チュートリアル & Question Grammar
ハッカソンに向けた基礎知識の共有と、研究の「問い」の立て方を学びます。データベース構造やColabチュートリアルコードを解説。(※参加できない方向けに後日YouTube公開)
Google Formでのアンケート提出・組分け提案
事前アンケートにご協力ください。提出いただいた興味関心をもとに、運営側でチームの組分け(5名程度)を提案します。
Day 1 Get Started
受付 & 希望者のみ昼食会
11:00開場・受付開始。希望者に無料でお弁当を提供します(本プログラムは13:00より開始)。
開催にあたって
中江 健(福井大学)行動変容生物学 Introduction
近藤 将史 & 瀬原 慧祐(東京大学)テーマ相談会 + 作業開始
チームごとに専門チューターとディスカッションを行い、解析テーマを決定・具体化します。
チーム作業
チームメンバーと協力しながらデータの前処理や探索的解析を進めます。
懇親会(ケータリング交流会)
会場内での立食交流会。研究者・チューター・参加者同士で自由に語り合いましょう。(会費 4,000円 / ケータリング・ソフトドリンク付)
Day 2 Deepen
チーム作業
解析アルゴリズムの実装や仮説検証を本格化させます。
昼食会(全脳アーキテクチャ・イニシアティブ Lunch on Seminar)
田和辻 可昌(全脳アーキテクチャ・イニシアティブ)昼食を取りながら先端トピック(全脳AI・神経情報処理)についての講演を聴講します。
チーム作業
セッションの知見も取り入れながら、チームで集中して解析アルゴリズムの実装と仮説検証を深めます。
Day 3 Share
チーム作業
解析の総仕上げと発表用データの整理を行います。
昼食会
各自昼食休憩・チーム内リフレッシュ。
発表のための準備相談
成果発表に向けたスライド作成と最終ディスカッション・リハーサル。
休憩
ハッカソン発表会
各チーム10〜15分程度の発表と質疑応答。点数評価ではなく、学術的な視点から有意義なフィードバックを行います。
おわりに
松崎 政紀(東京大学)参加案内
対象者
神経活動や行動データ解析に興味のある若手(大学院生・学部生を含む)やポスドク。定員40名程度。初学者も歓迎します。※先着順ではありません。応募者多数の場合は選考を行います。
環境・持ち物
WiFiでGoogle Colaboratoryが動くノートPC(Windows, Mac, Linux)をご持参ください。使用言語はPythonです。
対応OS:Windows / macOS / Linux
参加費・懇親会費
※懇親会への参加は任意です。参加希望者のみ懇親会費をお支払いいただきます。
会場アクセス
日本橋ライフサイエンスハブ
〒103-0022 東京都中央区日本橋室町1-5-5 室町ちばぎんビル8階
会場:室町ちばぎんビル 8階